A la par de la creación del AHA, se fundó también una biblioteca con bibliografía y hemerografía, principalmente de temática hidráulica. Los usuarios del archivo obtienen de la biblioteca información que puede ser útil en su investigación de archivo. Contiene hasta el momento 44 997  títulos catalogados (libros, tesis, obras generales de consulta, notas de prensa, folletos, discos compactos), de los cuales únicamente 39 000 se encuentran sistematizados y disponibles para su consulta.

Destaca la Colección de Estudios y Proyectos, con 11 252 títulos en 15 166 volúmenes, que concentra estudios realizados desde la CNI hasta la Conagua. La BCEP incrementa su acervo mediante convenios de donación y canje con instituciones académicas y otras bibliotecas.

Colección de Estudios y Proyectos

Estudios técnicos y de carácter socioeconómico (reconocimiento, semidetallados, detallados y especiales) de múltiples proyectos hidráulicos en el país, elaborados por ingenieros y consultores de la CNI, de la SAyF, SRH, SARH, Conagua y de otros que fueron encomendados a empresas privadas (en breve el catálogo podrá ser consultado en línea). 

Colección de Estudios y Proyectos